Já pensou em pegar um programa de qualquer computador e transferir ele para seu pendrive ou mesmo colocar ou outro PC/Partição? Então isso é simples e fácil, basta você ter o programa FreeMove, esse software consegue transferir qualquer programa do disco local C, para outro dispositivo sem problema algum.
E os atalhos? Sim todos vão continuar da mesma forma nesse caso se você transferir par ao mesmo PC. O programa FreeMove é portátil e grátis, roda em qualquer Windows.
E se eu quiser voltar o programa para a unidade C novamente, ou seja, onde eu tinha movido tal programa? Sim é possível basta ir no disco local C, excluir a pasta do programa que virou atalho e em seguida recortar a pasta do programa que foi movido para o disco C, lembre-se de para todos os processos do programa se ele está aberto.